Ο ιατρός Φλαμουράκης Ματθαίος γεννήθηκε στο Ηράκλειο, Κρήτης. Aπέκτησε το Πτυχίο Ιατρικής, από το Πανεπιστήμιο Seconda Universita degli Studi di Napoli, υπηρέτησε την θητεία του στο Ναυτικό Νοσοκομείο Κρήτης, στο τμήμα Χειρουργικής, ενώ στη συνέχεια μέχρι την ολοκλήρωση της ειδικότητας του εκπαιδεύτηκε στο Γενικό Νοσοκομείο Αγίου Νικολάου, στο Αντικαρκινικό Νοσοκομείο “Άγιος Σάββας” και στο Βενιζέλιο Πανάνειο Νοσοκομείο.
Το 2015 απέσπασε τον τίτλο της χειρουργικής ειδικότητας. Από το 2015 έως το 2022 εργαζόταν στο Βενιζέλιο Πανάνειο Νοσοκομείο, ως Γενικός Χειρουργός, εκτελώντας περισσότερα από 2000 χειρουργεία, αποκτώντας έτσι μεγάλη εμπειρία σε επείγοντα και τακτικά περιστατικά.
Το 2021 του απονεμήθηκε ο μεταπτυχιακός τίτλος σπουδών στο ΠΜΣ «Χειρουργική Παχέος Εντέρου – Πρωκτού» του Τμήματος Ιατρικής του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας.